Zinciriye Medresesi, 1385 yılında Melik Necmeddin İsa tarafından yaptırılmıştır. Timur ile savaşan Melik İsa, bir süre bu medresede hapsedilmiştir. Medrese aynı zamanda rasathane olarak kullanılması dolayısıyla yüksekte kurulmuştur.