Air Berlin yolcularının uçuşlarından önce mutlaka tamamlaması gereken web check-in işlemleri her uçuştan en erken 30 saat, en geç 3 saat önce yapılabilir. Web check-in hizmeti, ABD ve Küba uçuşları için uçağın kalkış anından 24 saat önce başlar ve uçuşa 3 saat kalana dek devam eder. Eğer aktarmalı uçuşunuz varsa ve ilk uçuşunuzu Air Berlin ile yapacaksanız, Air Berlin’in İnternet sitesi üzerinden web check-in işlemlerinizi yapmanız gerekir. Dakikalar içinde yapabileceğiniz web check-in için cep telefonu, tablet veya bilgisayarınızdan PNR numaranızla birlikte sisteme giriş yapmalısınız. Web check-in işlemlerinizi tamamladıktan sonra e-biletinizin çıktısını alarak havalimanında zaman kazanabilir ve doğrudan uçağa gidebilirsiniz. Bir diğer seçenek de barkodlu e-biletinizin mobil cihazınıza gelmesidir. Barkod okuyucu makinelere e-biletinizin açık olduğu mobil cihazınızı göstererek uçağa gidebilirsiniz. Ancak bunun için el bagajınızın dışında teslim etmeniz gereken başka bir bagajınızın olmaması gerekir. Havalimanındaki Air Berlin check-in kontuarları her uçuştan 120 dakika önce açılır ve uçağın kalkış ve varış destinasyonlarına göre uçuştan 30, 45, 60 veya 90 dakika önce kapanır. Varış noktası ABD ve Kanada olan seferlerden 180 dk, kalkış noktası ABD ve Kanada olan seferlerden de 240 dakika önce check-in kontuarları kapanır. Uçuşa 30 dakika kala check-in kontuarlarının kapandığı şehirlerden bazıları; Berlin (Tegel ve Schönefeld), Paris (Charles de Gaulle), Viyana, Münih, Krakow, Hamburg. Uçuşa 90 dakika kala check-in kontuarlarının kapandığı şehirlerden bazıları; Abu Dabi, Bangkok, Dubai, Johannesburg, Los Angeles, New York (JFK), Seul, Tokyo (Narita), Tallinn ve Zagreb.