Nevşehir, peribacalarının yanı sıra termal kaynaklarıyla da oldukça ünlü. Nevşehir'e bağlı Kozaklı ilçesi sahip olduğu şifalı kaplıcalarıyla sağlık turizmi açısından önemli bir yer. Şehrin 100 kilometre kuzeyinde yer alan Kozaklı kaplıcaları, Alman Kaplıcaları Birliği sınıflamasına göre sodyumlu, kalsiyumlu ve klorlu olup A ve C grubu şifalı sular grubuna giriyor. Buna bağlı olarak şehirde ve Kozaklı'da bulunan termal oteller yoğun ilgi görüyor.
Nevşehir'deki termal otellerde bulunan şifalı sular, eklem ağrıları, deri ve zührevi hastalıklar gibi çeşitli hastalıklara iyi geliyor. Bununla birlikte termal otellerin çoğunda, bir otelde bulunması gereken her şey mevcut. Ayrıca bu otellerde Türk hamamı, buhar odası, spa-masaj ve sauna gibi imkanlar da bulunabiliyor.